儿童癌症解码

经过格雷西·瓦莱纳(Gracie Valena)- 2011年6月14日2:8:0 GMT
儿童癌症解码

癌症是美国儿童和青少年疾病死亡的主要原因。现在,可以通过由小儿癌基因组项目田纳西州和华盛顿大学的圣裘德儿童研究医院。

被称为剪裁揭示了结构(波峰),该方法可以检测特定癌症独有的DNA染色体重排和插入或缺失。

例如,该方法用于发现五名患有急性淋巴细胞白血病T-Linege亚型的癌症基因组中的89个新结构差异。Crest能够检测复杂的染色体重排,其中包括涉及四个染色体的染色体。它也被用来在皮肤癌黑色素瘤细胞中发现50种新变化。

该研究的高级作者兼圣裘德计算生物学系的副成员Jinghui Zhang博士指出,该方法比其他类似方法更准确:“类似的工具错过了60%至70%在肿瘤中的这些结构重排中。Crest可确保科学家能够找到重要的结构变化,在肿瘤形成中起关键作用。”

2010年启动了共同的小儿癌症基因组项目,以“确定引起世界上最致命的童年癌的遗传变化”。它试图解码600多名儿童癌症患者的基因组。预计获得的知识将从根本上增加我们对儿童恶性肿瘤的理解,并为新的癌症治疗和预防创造基础。

有兴趣使用Crest的研究人员可以下载计算机算法和支持数据。

学习,基碱基因组中的冠状结构变化具有碱基对分辨率,并于2011年6月12日在线通过《大自然方法》在线发布。

顶部图片来源:©Benjaminet